分子诊断专家韩健:据悉基因测序的是与非

2022-01-17 03:20 来源:陇南男科医院

最近两周在国内外,听到议论最多的就是有关国家千户所生计生委发知会暂缓蛋白质测定技术开发的病理应用的事。

有关高通量基因组产前病理,我并未发表意见过不少(参见写作者该网站博客。编者注)。可是对千户所中组部的接二连三暂缓,还是有些感官值得和大家共享。

首先,我认为暂缓是对的。既然国家有系统性法律,就要按照法律服务器端办:子公司应该按照服务器端报批商品。看上去这是一个很接二连三的决定,其实也是必然。千户所中组部也是无奈,他们多次交涉系统性子公司,两三年来始终被顶着。如果不管,一旦当班,负有就首先在国家机构。

暂缓不是说是工具不科学,暂缓是说是一些子公司的不合理令人担忧,共存危险性。按照千户所中组部的解释,高通量基因组的器材,试剂,软件,都从未经过病理验证,所以暂缓。

下图是我以前介绍过的美国政府Sequenom子公司技术开发总监演讲的一个大屏幕:

无创产前病理的最大问题就是母血中孕期DNA纯度小(平均13%)而且变化范围宽(2%~35%)。就是说是,有的婴儿血中孕期DNA比较多,有的则非常少。这就给值得注意带来一个很急迫的问题:如何能直观量化分析每个婴儿肝细胞中孕期DNA的纯度?

有关技术开发问题,我劝告大家去读读无创产前病理技术开发的奠基者,香港中文大学的Dennis Lo的有关综述。据他介绍,如果母血中孕期DNA占游离DNA总数的10%,那么,多一条21号染色体所带来的“可用”接收机意味着是孕期DNA的5%。这么外推的上升需要极为正确地的量化工具才能测定到。美国政府新近做无创产前病理的子公司,也是和Dennis共同的子公司,Sequenom,有独特的量化工具,通过测定甲基化DNA在母血中的比重来矫正实验误差。

国内外子公司是如何量化的?愈来愈让我担心的是,因为垄断激烈,国内外子公司获取无创产前病理的款项都远超高于国内外的价格。因为Illumina子公司获取的试剂价格是一定的,所以利息空间愈来愈少。能把价格降高得这么高,就需要把许多病人标本合并起来一起基因组(pooling), 一次基因组分离的标本越多,平均价格就越便宜。国内外也pool,但是pool的不等需要严格病理验证。pool得越不行,测定那5%DNA增幅的敏感性也就越高,假形容词的几率就越大。所以,相比较,国内外和国内外比并未走样了,也就愈来愈需要通过严格的病理验证来表明这是切实可行的。

千户所中组部的这个暂缓知会,让我们比喻到九十年代后半期暂缓PCR的有关规定。当时暂缓PCR病理也是因为该技术开发被犯罪行为,扩增产物污染普遍,假阳性结果时常可见,千户所生部一再暂缓整顿。

可是,是否是有人想过,当后半期暂缓PCR和今天暂缓蛋白质基因组给中华人民共和国有机体医护科技产业带来了什么冲击?当后半期暂缓PCR是否是因为从未及时病理上升了社会胃癌病征的总数?暂缓PCR是否是使得许多在有机体技术开发餐饮业创业的子公司挽回了转回全球性市场的愈来愈进一步?暂缓唐氏无创产前病理是否是会上升患儿出生率?尽快中上对科学和社会都有好处。

所以,虽然我坚决千户所中组部有关暂缓的规定,但是我愈来愈渴望千户所中组部能网开一面,让技术开发创新、新商品有愈来愈多的愈来愈进一步转回病理实践。千户所中组部声称有“快速通道”,可是,无论是非典,还是禽流感,都表明那个“快速通道”实质上操作起来很难,环境因素太多,不够透明。

一个现成的组态就是美国政府有系统的CLIA(Clinical Laboratory Improvement Amendments)。 CLIA不归FDA管,而是另外一个政府机构CMS(The Centers for Medicare Max Medicaid Services)管,负责管理近25万个麻省理工学院。FDA管子公司生产线出来的商品,而CMS则管麻省理工学院服务。只要是有CLIA驾照的麻省理工学院,他们自己开发设计的剂型、技术开发等也可以合法转回病理,合理收费。

不过,最近FDA也多次声称要介入管理CLIA麻省理工学院,因为以前从未快递业务,麻省理工学院服务范围愈来愈少,所以危险性愈来愈少。一旦当班,冲击较大。可是如今有了快递业务,一个麻省理工学院的服务普通人可以覆盖全国,所以相应的危险性也上升了,和子公司的商品不相上下。

可是,如果从未CLIA麻省理工学院组态,技术开发创新只有通过了FDA才能转回病理,那很意味著美国政府也不会已是医护病理餐饮业的创新追随者。美国政府有4个获取无创产前病理的子公司,从未一个是FDA同意的,都是CLIA。

中华人民共和国应该借鉴美国政府CLIA组态,暂缓商品,重新启动服务。这样即能控制危险性,也能加速技术开发创新的病理应用。免费类似于CLIA的麻省理工学院管理组态,会吸引大量社会资金,提高医护高质量和效率。何必两会期间有代表提出系统性表决。

精彩互动(摘录该网站微博):

@微分:暂缓商品,免费服务。服务要由行政监督,医生与科学家组成委员会来推断直观性。恰巧各种皮包子公司雨后春笋般冒出来号称可以蛋白质基因组预测保健与智商及各种疾病,还有有钱不赚非君子的基因组子公司们也忍不住要出强迫症病理基因组的时候,再继续不暂缓就要出大乱子了!

@AfterToday:技术开发合理监管的要求是对的。但“如何能直观地分析每个婴儿肝细胞中孕期DNA的纯度?”为最大论题,韩指导教授,怎么感觉您完全是非呀,哎,多刚才文献吧。说是说是政策没人知道您不懂。sequenom不pool样本?

@有机体基础性创业-韩健 应有 @AfterToday 对博客 【千户所中组部暂缓蛋白质基因组的是与非】的评论: "Sequenom当然pool, 不过从未pool得那么不行。我是是非?唐氏前列腺癌我不是交家,是家交,两代人的努力。你自己多刚才文献吧。"

@AfterToday:嗯,肝细胞前列腺癌您是家交,拿复合物连和时间分辨垄断,勇气可嘉。诚然,在从未法规的时候,总有人会不择手段,国内外需要的是标准和监管。但不能因为暂缓就说是国内外有种种“现况”。您看到现况了?不来说是国内外混得不行?有原始数据?有观察?

@有机体基础性创业-韩健 应有 @AfterToday 对博客 【千户所中组部暂缓蛋白质基因组的是与非】的评论: "我并从未说是国内外有现况。只是说是暂缓有理。从未现况愈来愈好,按照规章制度报批,有何不妥?我愈来愈渴望借机另开转回市场的组态,让CLIA组态在国内外重新启动。"

@AfterToday:批评您说是的最大论题是如何直观测定孕期DNA纯度;您说您是前列腺癌家交,说是国内外比sequenom混得不行;批评您如何知道国内外混得不行;绕回去又说是原文中的CLIA……您是交家!

@Whale-T:“知会”里面有个第四条。

@聂超Nick:就事论事,韩老师说是的有用意。

@全人类de工程师:CLIA认证对于开发设计和生产线是极为适合的。

写作者简介:韩健,美国政府HudsonAlpha研究院研究员。从事分子检验病理平台技术开发的开发和免疫组库基础科研机构。

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